A competição terá 4 fases, sendo 3 fases virtuais e 1 fase presencial:
1ª fase (virtual – classificatória) de 27/08/2012 a 31/08/2012: 10 (dez) questões de múltipla escolha na área de agricultura, com peso 1 (10%).

 2ª fase (virtual – classificatória) de 27/08/2012 a  31/08/2012 : com 10 (dez) questões de múltipla escolha na área de zootecnia, com peso 1 (10%).

3ª fase (virtual – eliminatória e classificatória) de 03/09/2012 a 06/09/2012: com 20 (vinte) questões de múltipla escolha nas áreas de agricultura e zootecnia, com peso 2 (20%).

•  Serão classificadas para a 4ª fase as equipes que obtiverem aproveitamento igual ou superior a 2,8 pontos (70%) no somatório das 3 fases virtuais.
•  Participarão da 4ª fase 50 equipes do ensino médio/técnico, classificadas pelo somatório das pontuações das 3 fases anteriores.
•  Participarão da 4ª fase 10 equipes do ensino subsequente, classificadas pelo somatório das pontuações das 3 fases anteriores.
•  Em caso de empate, será utilizado o horário de início da resolução da terceira fase como forma de classificação, partindo do menor tempo decorrido da abertura da fase para o maior.

4ª fase (presencial) 11 e 12/10/2012: Nesta fase só participarão da prova os alunos e será composta de duas etapas.

• Primeira etapa (eliminatória): as equipes classificadas deverão enviar o estudo de caso  proposto referente ao tema da Olimpíada: Inovação e negócio, com peso 2 (20%). Os critérios para pontuação bem como as normas serão estabelecidos na proposta de estudo que será disponibilizada  no mês de março.  O envio do Estudo de Caso é pré-requisito para participação na fase presencial. A submissão da resolução do estudo de caso deverá ser realizada até as 12h do dia 14 de setembro de 2012.
• Segunda etapa (classificatória): os alunos farão individualmente prova contendo 20 questões objetivas com peso total 3 (30%) e 2 questões discursivas com peso total de 1,0 (10%), das áreas de zootecnia e agricultura. Com as notas individuais dos alunos será feita uma média que será somada à nota final da equipe.